Defosfokoenzým A kináza
Defosfokoenzým A kináza alebo defosfoCoA kináza (DPCK alebo CoaE; Šablóna:EC číslo) je enzým, ktorý katalyzuje nasledujúcu chemickú reakciu:
- ATP + defosfo-CoA ADP + CoA
Substráty tohto enzýmu sú teda ATP a defosfo-CoA, jeho produkty sú ADP a koenzým A (CoA).[1]
Klasifikácia
Tento enzým patrí medzi transferázy, konkrétne tie, ktoré presúvajú skupiny obsahujúce fosfor a akceptorom je hydroxylová skupina. Systematický názov tohto enzýmu je ATP:defosfo-CoA 3'-fosfotransferáza.
Význam
DPCK katalyzuje posledný krok v syntéze koenzýmu A.[2][3] Predchádzajúci krok tejto dráhy, syntézu defosfo-CoA, katalyzuje fosfopanteteínadenylyltransferáza.
Gén
Tento enzým bol poprvé izolovaný z Corynebacterium ammoniogenes. Pomocou neho bola určená sekvencia, ku ktorej potom bol nájdený gén yacE u E. coli, ktorý mal vysoký stupeň homológie. Tento gén bol následne premenovaný na coaE. Na základe toho sa tento enzým niekedy označuje ako CoaE.[3]
Štruktúra
DPCK pochádzajúci z E. coli je monomér s hmotnosťou 22 kDa, ktorý v prítomnosti síranových aniónov tvorí trimér v roztoku i kryštálovej štruktúre. Enzým sa skladá z troch domén: domény viažucej nukleotidy, domény viažucej substrát a „príklopnej“ domény. Predpokladá sa, že posledné dve domény sú veľmi pohyblivé a po naviazaná defosfo-CoA sa enzým „uzavrie“, čím uľahčí prenos fosfátovej skupiny.[3]
U cicavcov je PPAT spojená s defosfo-CoA kinázou do bifunkčného enzýmu, ktorý sa označuje ako CoA syntáza.[3]
Na konci roka 2023 bolo známych 24 štruktúr tohto enzýmu, s PDB kódmi Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz a Šablóna:PDB odkaz.