Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza
Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza (PPCD alebo CoaC; Šablóna:EC číslo) je enzým, ktorý katalyzuje nasledujúcu chemickú reakciu:
- N-[(R)-4'-fosfopantotenoyl]-L-cysteín 4'-fosfopantoteín + CO2
Substrát tohto enzýmu je teda 4'-fosfopantotenoylcysteín, jeho produkty sú 4'-fosfopantoteín a CO2.[1]
Klasifikácia
Tento enzým patrí medzi lyázy, konkrétne štiepiace väzbu uhlík-uhlík, ktoré štiepia karboxylovú skupinu.
Význam
PPCD sa účastní biosyntézy koenzýmu A (CoA) z kyseliny pantoténovej.[2] Katalyzuje tretí krok tejto dráhy, pričom predchádzajúci krok je katalyzovaný fosfopantotenát-cysteín ligázou a nasledujúci krok katalyzuje fosfopanteteínadenylyltransferáza.[2]
Gén
Nezávisle na sebe bolo zistené, že gén dfp u E. coli má fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú a fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú aktivitu. Jednotlivé domény a k nim prislúchajúce gény, plus homológne gény, ktoré majú len jednu z týchto aktivít, boli neskôr premenované na coaB a coaC. Na základe toho sa PPCD niekedy označuje i ako CoaC, podľa génu, ktorý ju kóduje. Bifunkčný enzým sa potom označuje ako CoaBC.[2]
Štruktúra
PPCD vo svojej štruktúre viaže flavínmononukleotid (FMN).[2] FMN oxiduje cysteín a katalyzuje tvorbu tioaldehydu, ktorý následne dekarboxyluje. Nakoniec dochádza k redukcii tioaldehydu za vzniku cysteamínovej skupiny.[2][3]
U drvivej väčšiny prokaryotov, vrátane Mycobacterium tuberculosis, je tento enzým súčasťou bifunkčného enzýmu, ktorý má zároveň i fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú aktivitu.[4]
Na konci roka 2023 bolo známych 11 štruktúr tohto enzýmu, s PDB kódmi Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz, Šablóna:PDB odkaz a Šablóna:PDB odkaz.