Zobrazenie zdroja stránky Fosfopantotenát-cysteín ligáza

{{Infobox Enzým|číslo EC=6.3.2.5|číslo CAS=9023-50-1|obrázok=E. coli Phosphopantothenoylcysteine synthetase PDB 1U7Z.svg|popisObrázka=Fosfopantotenát-cysteín ligáza z ''E. coli'' v komplexe s CTP, PDB 1U7Z}}

'''Fosfopantotenát-cysteín ligáza''' alebo '''fosfopantotenoylcysteínsyntetáza''' ('''PPCS''' alebo '''CoaB'''; {{EC číslo|6.3.2.5}} a {{EC číslo|6.3.2.51}}, pozri nižšie) je [[enzým]], ktorý katalyzuje nasledujúcu [[Chemická reakcia|chemickú reakciu]]:

: NTP + 4'-fosfopantotenát + <small>L</small>-cysteín <math>\rightleftharpoons</math> NMP + PP<sub>i</sub> + 4'-fosfopantotenoylcysteín

[[Substrát (biochémia)|Substráty]] tohto enzýmu sú teda [[nukleozidtrifosfát]] (NTP), [[Fosfopantotenát|4'-fosfopantotenát]] a [[cysteín]], jeho produkty sú [[nukleozidmonofosfát]] (NMP), [[pyrofosfát]] (PP<sub>i</sub>) a [[Fosfopantotenoylcysteín|4'-fosfopantotenoylcysteín]].<ref name=":0">{{Citácia elektronického dokumentu | titul = ENZYME - 6.3.2.5 phosphopantothenate--cysteine ligase (CTP) | url = https://enzyme.expasy.org/EC/6.3.2.5 | vydavateľ = enzyme.expasy.org | dátum prístupu = 2023-11-29}}</ref><ref name=":1">{{Citácia elektronického dokumentu | titul = ENZYME - 6.3.2.51 phosphopantothenate--cysteine ligase (ATP) | url = https://enzyme.expasy.org/EC/6.3.2.51 | vydavateľ = enzyme.expasy.org | dátum prístupu = 2023-11-29}}</ref>

== Klasifikácia ==
Tento enzým patrí medzi [[Ligáza|ligázy]], konkrétne tie, ktoré katalyzujú tvorbu väzby uhlík-dusík medzi [[Kyselina|kyselinou]] a [[Aminokyselina|aminokyselinou]] (syntázy [[Peptid|peptidov]]). Systematický názov tohto enzýmu je '''(''R'')-4'-fosfopantotenát:L-cysteín ligáza'''.

== Význam ==
Táto reakcia predstavuje [[Koenzým A#Biosyntéza|druhý z piatich krokov]] premeny [[Pantotenát|pantotenátu]] na [[koenzým A]]. Predchádzajúci krok katalyzuje [[pantotenátkináza]], nasledujúci krok katalyzuje [[fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza]].<ref name=":2">{{Citácia periodika|titul=Biosynthesis of Pantothenic Acid and Coenzyme A|url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/ecosalplus.3.6.3.4|periodikum=EcoSal Plus|dátum=2007-09-13|dátum prístupu=2023-11-29|ročník=2|číslo=2|issn=2324-6200|doi=10.1128/ecosalplus.3.6.3.4|jazyk=en|meno=Roberta|priezvisko=Leonardi|meno2=Suzanne|priezvisko2=Jackowski}}</ref><ref>{{Citácia periodika|titul=Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site|url=https://www.nature.com/articles/s41467-020-20224-x|periodikum=Nature Communications|dátum=2021-01-08|dátum prístupu=2023-11-29|ročník=12|číslo=1|strany=143|issn=2041-1723|doi=10.1038/s41467-020-20224-x|jazyk=en|meno=Vitor|priezvisko=Mendes|meno2=Simon R.|priezvisko2=Green|meno3=Joanna C.|priezvisko3=Evans}}</ref> 

== Gén ==
Tento enzým je u ľudí kódovaný génom PPCS.<ref name="entrez">{{cite web|title=Entrez Gene: Phosphopantothenoylcysteine synthetase|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=retrieve&list_uids=79717}}</ref>

Nezávisle na sebe bolo zistené, že gén ''dfp'' u ''[[E. coli]]'' má fosfopantotenoylcysteínsyntetázovú a fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú aktivitu. Jednotlivé domény a k nim prislúchajúce gény, plus [[Homológia (biológia)|homológne]] gény, ktoré majú len jednu z týchto aktivít, boli neskôr premenované na ''coaB'' a ''coaC''. Na základe toho sa PPCS niekedy označuje i ako CoaB, podľa génu, ktorý ju kóduje. Bifunkčný enzým sa potom označuje ako CoaBC.<ref name=":2" />

== Štruktúra ==
Rôzne organizmy využívajú v tejto reakcii rôzne NTP. PPCS z baktérie ''[[Escherichia coli]]'' využíva [[cytidíntrifosfát]] (CTP) ako zdroj energie, zatiaľ čo ľudská [[Proteínová izoforma|izoforma]] tohto enzýmu využíva [[adenozíntrifosfát]] (ATP).<ref>{{Cite journal|doi=10.1016/S0969-2126(03)00146-1|journal=Structure|date=Aug 2003|volume=11|issue=8|pages=927–936|title=Structure of human phosphopantothenoylcysteine synthetase at 2.3 A resolution|vauthors=Manoj N, Strauss E, Begley TP, Ealick SE|pmid=12906824|doi-access=free}}</ref> Na základe toho má tento enzým priradené dve rôzne [[Číslo EC|čísla EC]]: 6.3.2.5 pre enzýmy využívajúce CTP<ref name=":0" /> a 6.3.2.51 pre enzýmy využívajúce ATP.<ref name=":1" />

U drvivej väčšiny prokaryotov, vrátane ''[[Mycobacterium tuberculosis]]'', je tento enzým súčasťou bifunkčného enzýmu, ktorý má zároveň i [[Fosfopantotenoylcysteíndekarboxyláza|fosfopantotenoylcysteíndekarboxylázovú]] aktivitu.<ref>{{Citácia periodika|titul=Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site|url=https://www.nature.com/articles/s41467-020-20224-x|periodikum=Nature Communications|dátum=2021-01-08|dátum prístupu=2023-11-29|ročník=12|číslo=1|strany=143|issn=2041-1723|doi=10.1038/s41467-020-20224-x|jazyk=en|meno=Vitor|priezvisko=Mendes|meno2=Simon R.|priezvisko2=Green|meno3=Joanna C.|priezvisko3=Evans}}</ref>

Na konci roka 2023 bolo známych 12 štruktúr tohto enzýmu, s [[Protein Data Bank|PDB]] kódmi {{PDB odkaz|5INT}}, {{PDB odkaz|4QJI}}, {{PDB odkaz|1U7U}}, {{PDB odkaz|1U7W}}, {{PDB odkaz|1U7Z}}, {{PDB odkaz|1U80}}, {{PDB odkaz|6THC}}, {{PDB odkaz|6TGV}}, {{PDB odkaz|6TH2}} a {{PDB odkaz|1P9O}} pre EC 6.3.2.5 a PDB kódmi {{PDB odkaz|1P9O}} a {{PDB odkaz|7EDZ}} pre EC 6.3.2.51. Štruktúry pre rôzne čísla EC majú rôznu sekvenciu, ale ten istý [[Fold (bielkoviny)|fold]].

== Referencie ==
{{reflist}}

== Ďalšia literatúra ==
{{refbegin}}
* {{cite journal|author=Brown GM|year=1959|title=The metabolism of pantothenic acid|journal=J. Biol. Chem.|volume=234|pages=370&ndash;8|pmid=13630913|issue=2|doi=10.1016/S0021-9258(18)70307-4|doi-access=free}}
* {{cite journal|vauthors=Strauss E, Kinsland C, Ge Y, McLafferty FW, Begley TP|year=2001|title=Phosphopantothenoylcysteine synthetase from Escherichia coli Identification and characterization of the last unidentified coenzyme A biosynthetic enzyme in bacteria|journal=J. Biol. Chem.|volume=276|pages=13513&ndash;6|pmid=11278255|issue=17|doi=10.1074/jbc.C100033200|doi-access=free}}
* {{cite journal|author=Kupke T|year=2002|title=Molecular characterization of the 4'-phosphopantothenoylcysteine synthetase domain of bacterial dfp flavoproteins|journal=J. Biol. Chem.|volume=277|pages=36137&ndash;45|pmid=12140293|doi=10.1074/jbc.M206188200|issue=39|doi-access=free}}
{{refend}}

== Zdroj ==
{{Preklad|en|Phosphopantothenate—cysteine ligase|1172357342}}{{Biosyntéza koenzýmu A}}
[[Kategória:Ligázy]]